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A jornada de Jiraiya para procurar um aluno é adiada devido à eclosão da Terceira Grande Guerra Ninja. Jiraiya se junta a Tsunade e Orochimaru para lutar contra a Vila Escondida na Chuva. Após a batalha, os três ninjas são chamados de "Sannin Lendário", um título dado a eles pelo próprio inimigo Hanzo da Grande Salamandra.