Robby e Mo estão sozinhos e vulneráveis em Cybertron. Depois de se aventurarem no desconhecido para descobrir o que perderam, o resto dos Maltos e os Autobots chegam para procurar sua família e amigos desaparecidos. O fracasso não é uma opção, então Thrash se aproxima para ajudar sua irmã a liderar esta importante missão. A tensão aumenta entre o problemático Twitch e o ultraconfiante Thrash - dividindo a equipe quando eles precisam estar unidos. Enquanto isso, Robby e Mo encontram um novo amigo, e Optimus encontra um velho inimigo. Um confronto deixa os Maltos e os Autobots severamente enfraquecidos e espalhados por todo Cybertron enquanto seu inimigo ganha força e poder incríveis. Twitch se perde, Robby atinge o fundo do poço e Optimus Prime acredita que seus piores medos se tornaram realidade. Cada um deve enfrentar seus maiores desafios sozinho, e cada um precisa ter sucesso se quiser ter uma chance de derrotar o mal crescente em Cybertron, ameaçando lançar sua sombra por todo o universo. Felizmente, é na escuridão que a esperança brilha mais.